百日咳恢复期通常从阵发性痉咳减少开始计算，一般持续2-3周，判断标准主要有症状减轻、发作频率降低、血常规指标改善、细菌培养转阴。

1、症状减轻

恢复期咳嗽强度明显减弱，特征性鸡鸣样回声消失，夜间发作次数减少，不再伴随呕吐或发绀。

2、频率降低

阵发性痉咳从每日10余次减至3-5次，每次持续时间缩短至10秒内，咳嗽间歇期逐渐延长。

3、指标改善

外周血白细胞计数降至10×10⁹/L以下，淋巴细胞比例恢复正常，C反应蛋白等炎性指标趋于平稳。

4、病原清除

鼻咽部分泌物培养连续2次未见百日咳杆菌，或PCR检测转为阴性，提示传染性基本消失。

恢复期仍须保持室内空气流通，避免烟雾刺激，适当补充水分与营养，密切观察有无并发肺炎等征兆。