做肛瘘手术通常会在麻醉下进行，术中无明显痛感，但术后麻醉消退后会有一定程度的疼痛。疼痛程度主要与手术方式、个人痛阈、术后护理等因素有关。

1、手术方式

传统切开术创伤较大，术后疼痛较明显；微创手术如肛瘘镜或激光手术，创伤小，术后疼痛相对较轻。

2、麻醉方式

腰麻或硬膜外麻醉下手术全程无痛，术后麻醉消退后伤口开始出现疼痛；局部麻醉可能术中仍有轻微牵拉感。

3、个人痛阈

每个人对疼痛的耐受能力不同，痛阈较低的人术后会感觉更痛，痛阈较高的人则可能仅感到轻微不适。

4、术后护理

术后按时换药、保持大便通畅、避免便秘和剧烈活动，可减轻伤口牵拉和感染引起的疼痛。

术后疼痛通常在24至48小时内最明显，之后逐渐减轻。建议术后遵医嘱使用止痛药物，并注意饮食清淡、多饮水、避免久坐，以促进伤口愈合和减轻不适。