先天性心脏病最主要的病因是遗传因素。虽然环境、感染等因素也有影响，但多数情况与基因异常有关。

1、遗传因素

染色体异常或单基因突变导致心脏发育关键蛋白缺失，如唐氏综合征患者常伴发室间隔缺损。

2、宫内感染

妊娠早期感染风疹病毒、巨细胞病毒等，干扰胎儿心脏组织正常分化，引发瓣膜畸形。

3、药物致畸

孕期服用抗癫痫药、锂盐或某些抗生素，通过胎盘屏障损害胚胎心血管系统发育。

4、代谢异常

孕妇患有糖尿病或苯丙酮尿症，高血糖或毒性代谢产物积聚，阻碍心脏结构形成。

建议备孕女性进行遗传咨询，孕期严格避免接触致畸物质并定期产检筛查。