双氧水可以杀死部分真菌，但效果因真菌种类和浓度而异。双氧水主要通过氧化作用破坏真菌细胞结构，对皮肤浅表真菌感染有一定抑制作用，但对深部或顽固性真菌效果有限。

3%医用双氧水常用于处理皮肤黏膜的浅表真菌感染，如足癣、股癣等。其氧化作用能快速杀灭暴露的真菌孢子，并清洁创面。对于念珠菌属、毛癣菌属等常见致病真菌，短期接触可降低其活性。但双氧水作用时间较短，无法持续抑制真菌再生，且可能刺激健康皮肤。

深层真菌感染如甲癣、系统性真菌病等，双氧水难以渗透至病灶深处。部分真菌如隐球菌、曲霉菌等具有较厚细胞壁，对氧化剂耐受性较强。高浓度双氧水虽可能增强杀菌效果，但会导致组织损伤，不建议自行使用。对于真菌性角膜炎、肺部真菌感染等严重情况，需配合抗真菌药物系统治疗。

使用双氧水处理真菌感染时，建议先清洁患处，用无菌棉签蘸取适量3%双氧水局部涂抹，避免接触眼睛及黏膜。若出现皮肤红肿、灼痛等反应应立即停用。日常需保持患处干燥通风，避免抓挠，衣物毛巾定期消毒。顽固性真菌感染或症状加重时，应及时就医进行真菌培养和药敏试验，遵医嘱使用硝酸咪康唑乳膏、联苯苄唑溶液等专业抗真菌药物。