新生儿心肌酶超过1000单位/升属于明显异常，需警惕心肌损伤。可能原因包括缺氧缺血性脑病、宫内感染、代谢性疾病、遗传性心肌病等。

1、缺氧缺血

分娩过程中缺氧可能导致心肌细胞损伤，表现为肌酸激酶同工酶升高。需进行心电监护并给予营养心肌治疗，如磷酸肌酸钠。

2、宫内感染

巨细胞病毒等病原体感染可导致心肌炎，除心肌酶升高外常伴有发热、喂养困难。需进行抗病毒治疗并使用免疫球蛋白。

3、代谢异常

脂肪酸代谢障碍等先天性疾病可引发心肌损害，多伴有低血糖、肌张力异常。需进行代谢筛查并给予左卡尼汀等特殊配方奶。

4、遗传因素

肥厚型心肌病等遗传性疾病在新生儿期即可出现心肌酶显著升高，需通过心脏超声和基因检测确诊，必要时使用β受体阻滞剂。

建议立即转诊至新生儿重症监护病房，完善心肌标志物、心脏超声等检查，在医生指导下进行针对性治疗，喂养时注意控制奶量和速度。