右侧附件囊肿是否影响怀孕需结合囊肿类型和大小判断，常见有生理性囊肿、卵巢囊肿、输卵管积水、子宫内膜异位囊肿等，多数小囊肿不影响受孕，部分可能影响排卵或受精卵着床。

1、生理性囊肿

黄体囊肿等生理性囊肿通常在月经周期后自行消退，无需特殊干预，定期复查即可，不影响正常怀孕。

2、卵巢囊肿

体积较大的卵巢囊肿可能压迫卵巢组织，与内分泌紊乱、慢性炎症等因素有关，可能伴随月经异常，需遵医嘱使用桂枝茯苓胶囊、红金消结片等药物或微创手术处理。

3、输卵管积水

输卵管炎症导致的积水可能阻碍精卵结合，与盆腔感染史相关，常见下腹坠痛，可考虑腹腔镜手术或抗生素治疗。

4、巧囊

子宫内膜异位囊肿可能破坏卵巢储备功能，与经血逆流有关，常表现为痛经进行性加重，需药物抑制内膜生长或手术剔除囊肿。

备孕前建议妇科超声和激素检查，5厘米以上囊肿或存在不孕史时需优先处理，日常避免剧烈运动以防囊肿扭转破裂。