对于癫痫患者来说，一但药物治疗对控制病情不理想，就可以考虑进行手术治疗，以达到控制癫痫发作的目的。由于癫痫是由于脑神经细胞反复异常放电引起的各种症状。
而异常放电的起始区就是引起癫痫的癫痫灶，如果能够利用手术的方法切除引起发作的癫痫灶，就可以根除癫痫，控制发作。
目前癫痫手术治疗的种类可分为三种。
(1)局部切除手术：手术切除局部的或大块的有致癫痫病灶的脑组织，
消除癫痫灶和癫痫源区。此类手术有前颞叶切除术、选择性杏仁核海马切除术、大脑半球切除术及病灶切除术。
(2)阻断癲痫发放传播通路的手术：通过破坏癡痫发放的传播通路，提高癫痫阈值，毁损癫痫的兴奋机构来阻断癫痫发作。
常用的手术有胼胝体切开术和多处软脑膜下横切术。
(3)毁损和刺激术：有脑立体定向核团射频毁损术，如杏仁、海马、Forel-H区等及电刺激术如慢性小脑刺激术和迷走神经刺激术，刺激癫痫的抑制结构。另外，目前还开展X-刀，γ-刀等立体定向放射治疗。
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