引起少精子症的原因比较多，应该在治疗之前先确定病因，然后根据实际情况确定治疗方案。
消除感染
如果有感染可能，如急慢性睾丸炎、附睾炎、前列腺炎、精囊炎等，应该检查解脲支原体、沙眼衣原体、抗生殖支原体等，还要分别感染的部位，是精囊炎还是前列腺炎。感染引起的精子异常，一般在感染消除之后会逐步恢复的。
内分泌功能异常引起的少精症
一部分患者服克罗米芬可提高精子数量，每日25mg，每月服25日，停5日，6-12个月为一疗程。有报道长期服用可降低形态正常精子的百分率,故目前推荐用低剂量疗法,即隔日25mg。也可以采用人绒毛膜促性腺激素1000u,每周肌肉注射2次，8-10周为一疗程;同时可每日内服维生素E100-200mg，连服3-4个月。
精索静脉曲张引起的少精症
如果不严重，或者病程比较短，可以使用中药化瘀通管胶囊加促精宝胶囊治疗。
对于病情严重的，可作精索静脉结扎术，一般在术后1年精子密度升高者约50%-80%以上。对于手术后恢复速度不理想者，可以使用促精宝胶囊治疗。
没有明显病因引起的少精症
要检查患者身体的微量元素，比如锌元素等。补锌对少精和死精症有一定疗效，服药后精子数量明显增加。由于锌和铜的拮抗作用，补锌同时治疗高铜。一般每次口服葡萄糖酸锌50-100mg，每日2次，3个月为一疗程，也有采用硫酸锌治疗的。
必要时补充精氨酸
精氨酸是生成精子的必要成分，少精症患者的精液中，精氨酸含量明显低于正常男性。补充精氨酸，每日口服4克，连续10周，可以使精子计数提高、活力上升。
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