以往对精囊的物理检查及输精管造影是唯一可利用的诊断方法。尽管目前经直肠超声检查(TRUS)、CT和MRI广泛用于精囊疾病的诊断，但是直肠指诊仍然是一种不可忽视的诊断手段。检查前，患者要排空尿液，患者站立、腹部靠近检查台一侧弯腰接受检查。也可取膝胸位，年老体弱或危重患者宜仰卧位或侧卧位检查。
检查时患者要张口放松。检查者戴好指套或手套，涂润滑剂，用食指在肛门处轻轻按摩后缓慢伸人直肠深部进行检查。检查顺序为前列腺、精囊，然后手指旋转360度，最后为直肠、肛门。
1、在正常男性，精囊及其邻近管道一般不易被触及。在直肠指诊时，位于前列腺基底部存在精囊的区域呈柔软而光滑。精囊位于周围相对厚而无弹性的两层筋膜前方，但即使这一腺体呈不对称性，通常也不能通过触诊来正确评价精囊及输精管壶腹等任何解剖细节。
2、如有急性炎症时，则两侧精囊肿大、有压痛。
3、存在精囊囊肿或精囊积液时，直肠指诊时则前列腺上方区域可能增大，并相对可压缩。
4、如果有精囊肿瘤时则可能为实质性坚硬的肿块。
5、精囊结核常与前列腺结核同时发生，精囊可有结核浸润结节然而，这些病变也可能向前压迫膀胱基底部，因而并不是都能触及。精囊继发于前列腺和膀胱的损害，则可在前列腺上方触及坚硬区。前列腺癌累及精囊时，可触及精囊不规则硬结。
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