儿童尖锐湿疣的传染途径相对比较复杂，可能是通过多种途径传染而引起。而且不同性别、不同年龄、不同部位的尖锐湿疣在很大程度上与不同的传染途径有关。
总的来看，儿童尖锐湿疣的传染途径大多以非性接触传染途径为主要途径，尤其是在婴幼儿期，几乎不可能有性接触传染途径存在，这是与成年人主要是经性接触传染途径的主要区别。但对年龄较大的儿童患尖锐湿疣则要考虑有性虐待等多方面因素。国外有学者认为，当儿童被确诊为尖锐湿疣时，医生应意识到存在性虐待的可能性。
归纳起来，儿童尖锐湿疣非性接触传染途径可能有：
①垂直传染：即在妊娠期间孕妇HPV感染通过胎盘传染给胎儿;
②宫内传染：即胎儿通过吞饮含HPV的羊水而被传染;
③产道传染：即婴幼儿经过有尖锐湿疣或HPV感染的产道时被传染;
④接触物传染：即儿童在日常生活中与有尖锐湿疣的患者或HPV感染者如其父母、家庭中其他成员或保姆、幼教老师等的密切接触而被传染。
这些接触物可能是尖锐湿疣损害、病变分泌物以及被HPV污染的衣物、毛巾等;
⑤异体接种和/或自体接种传染：即通过手接触生殖器传染，如当有尖锐湿疣的患者之手接触尖锐湿疣损害或HPV污染的物品后再接触正常儿童皮肤粘膜则引起异体间接种传染，或有尖锐湿疣的患儿接触疣体的手再接触其自体正常皮肤粘膜而导致自体接种传染。
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