正常人尿液中的一些溶解物质，因各种原因造成沉淀，潴留于肾内，并持续生长，便可形成结石。肾结石多发生在中壮年，男性多于女性。肾结石可能长期存在而无症状，特别是较大的结石。
结石患者尿中常存在红细胞、白细胞及核异质改变的上皮细胞，这是由于结石的存在可造成黏膜损伤和溃疡，诱发急慢性感染，还会降低肾脏对血源性感染的抵抗力，尤其是鹿角样结石，由于压迫肾实质缺血而继发感染，后者既促进结石的生长，又加速肾脏的损害。
感染常在结石梗阻时发生，引起结石性肾积液，结石甚至会穿破肾组织形成窦道。如果感染未伴梗阻，即发生结石性肾盂炎，造成肾盂肾盏黏膜增生、增厚、纤维化、脓肿形成，如病情继续发展可使患肾与周围组织发生炎性粘连。长期感染物质的引流可能导致
再加上夏季暴露于阳光下时间长，紫外线照射皮肤有助于体内维生素D和维生素A合成增多，进而促进小肠对钙离子的吸收，尿液中排泄钙增多，尿内结石物质易产生结晶核，从而形成结石。冬季天气寒冷，人的尿量增多，已形成的小结石被尿液冲刷，向下移动，此时引起肾绞痛症状。
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