甲亢是一种疗程较长的疾病，治疗过程少则1~2年，多则十几年，给患者带来很大烦恼，治疗过程中导致病情复杂，疗程较长的原因主要包括以下几个方面：
误食含碘食物：碘是甲状腺合成甲状腺素的必要原料。
甲亢患者的用碘量远远超过了正常人，而制造出过多的甲状腺素，使人体出现怕热、多汗、心悸、体重减轻、食欲增大等症状，如果再多食含碘食物如：海带、紫菜等，就会给甲状腺提供过多的原料，制造出更多的甲状腺素，减少了药物抑制甲状腺合成的作用，另外，这些碘类食物可在甲状腺储存270多天，影响治疗过程。
误服含碘药物：尤其是在使用中药治疗的过程中，中医认为甲亢为“瘿瘤”是由于缺碘引起，治疗时会用海藻、昆布等药物。但是有些甲亢不是因为缺碘而引起，因此应用这些药物无疑是火上浇油。
药物治疗不规范：甲亢是一种慢性疾病，疗程较长，一些患者只吃几天药未明显见效就另寻他途，有些药物在这么短的时间内跟本不能发挥药效，所以得坚持治疗，才会有效。
还有些人认为症状消失就是痊愈了，于是中断服药，导致病情又加重，这也是治疗过程加长的原因。
拒绝手术及放射治疗：手术治疗和放射性碘治疗对有些甲亢患者是很有必要的，但是有些患者害怕其副作用，即使符合治疗标准也不愿采取这两种治疗方法，从而导致疗程长。
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