临床上白癜风由于个体差异很大，即使是一个患者，在不同的时期，不同部位的疗效都有明显的差异，常见的影响疗效的因素有：
毛囊稀疏部位白斑恢复较慢
凡毛囊密布的部位，白斑易恢复，治疗效果好。
而毛囊稀疏的部位，白斑恢复慢，治疗效果差。临床上小腹部白斑的色素岛，间隔距离大，即使色素岛增大至豌豆大小，但仍不能完全覆盖白斑，最终形成麻雀卵样外观。虽然从治疗学的角度讲，效果已经比较好了，或者可以说接近于临床痊愈了，但从美容视觉感受上讲，与白斑无大差异，甚至还不如治疗前的白斑在视觉感受上更易于接受。
色素浅，黑色素细胞少的部位治疗效果差
有些部位虽有毛发，但都是终毛，色素浅，黑素细胞少，治疗效果也差。甚至长年治疗而无效。而毛囊发达的有毛部位，治疗效果要好些。
白斑区毛发已变白部位治疗困难
如果白斑区的毛发已变白，这表明在白癜风进展过程中，毛囊中的黑素细胞储库破坏了或被耗尽，故治疗相当困难。
无毛部位的白斑药物治疗无效
无毛皮肤如：口唇、指尖、唇红、乳头、龟头等部位的白斑，一般采用药物治疗是无效的。
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