目前可应用于前列腺炎治疗的抗菌药物种类繁多，要想达到最好的治疗效果，一定要选择最合适的药物。
治疗前列腺炎选抗菌药物时应遵循如下原则：
1.选药前应通过前列腺液的细菌培养检查，明确致病的细菌，选择对细菌有较高敏感性的药物，
2.确定应用的药物应以高脂溶性、高渗透能力、与血浆蛋白结合率低、离解度高的药物为标准，两种以上并有增效作用的药物建议联合使用。
3.使药物在前列腺间质中达到有效浓度及防止尿道感染的发生，应提倡超大剂量和超时限(4~12周)的用药法。
4.在用药方向不太明确的情况下，应该优先考虑采用抗菌谱大、覆盖面广泛的广谱抗菌药物。
5.经验治疗：研究表明，前列腺炎条件致病性细菌，80%是大肠埃希杆菌，余下的20%可以是变形杆菌、产气杆菌、棒状杆菌等，在没有前列腺液细菌检测资料作为参考时，可以采用含氟喹诺酮类抗菌药物。
根据有无细菌入侵，前列腺炎可分为细菌性前列腺炎与非细菌性前列腺炎，对于病灶中没有致病菌的患者，不宜选择抗菌药物进行治疗，应果断采取其他有效治疗措施。
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