胃手术后残胃发生癌变是一个复杂的生物学过程，与胃切除术后胃内环境改变、幽门螺杆菌感染之间有着密切的关系。
胃术后残胃内环境改变而导致的促发因素包括以下2个方面：
1.十二指肠-胃反流
残胃由于解剖生理改变，失去幽门的抗反流作用，存在不同程度的十二指肠-胃反流现象，而反流液中碱性肠液胆汁等长期反流、浸泡，引起吻合口附近胃黏膜发生残胃炎、肠腺化生、腺体囊性变、不典型增生、腺瘤样变，以致癌变等一系列病理变化。
2.胃内细菌过度生长
胃大部切除后，切除了大部分泌酸腺体，加之胃肠吻合术后存在不同程度的十二指肠反流，胃内pH值较高，而胃内pH是决定胃内菌群的主要因素，pH高于4的胃液总菌数较正常人胃液的总数增高。而残胃内大便菌群定值可催化亚硝基反应，促进亚硝酸和N-亚硝基化合物的形成，亚硝胺是目前公认的致癌物之一。
其次大便菌群中某些细菌还能分解反流入胃的结合型初级胆酸，形成游离型次级胆酸，如脱氧胆酸、石胆酸、后者既会损伤胃黏膜屏障，又能诱发黏膜癌变。
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