短暂性脑缺血发作与癫痫发作，都会出现突然、短暂且反复的脑部功能失常，尽管它们表现的症状有相似之处，但还是可以区别的。
首先，从发病原理（机制）上看：短暂性脑缺血发作是由血管不正常引起；而癫痫是脑细胞过度放电性病。
其次，从发病年龄看：短暂性脑缺血发作多见于老年人，常有动脉硬化、高血压病、冠心病、糖尿病等心脑血管病危险因素，发病持续时间从数分钟到数小时不等；而癫痫发作可见于任何年龄的人，且青少年更多见。没有明显危险因素，持续时间只有几分钟，不会超过半小时。
再次，从发病症状看：短暂性脑缺血的肢体瘫痪比抽搐多；而癫痫则恰好相反。同时，短暂性脑缺血发作者没有癫痫病史，发作期无规律性抽搐；而癫痫一般与之相反。
此外，短暂性脑缺血发作多在站立、走动或过度仰头时发生，平卧可减轻，神志清楚；而癫痫多与之不同。
最后，从检查结果看：患短暂性脑缺血的人在发病期和间歇期（不发作时间），脑电图正常；后者多相反。此外，短暂性脑缺血若做了颈动脉内膜切除术，大多就不发病了；而癫痫只有用抗癫痫药才能有效控制其发作。
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