关于细菌性前列腺炎的发病机制学界主要存在几种理论假说。其中较为重要的一种理论认为前列腺的感染是由上行性的尿路感染所引起的。
这种情况非常多见，特别是在年轻的男性中，可以在性交后发生逆行性的尿路感染
对于一般的尿路感染和细菌性前列腺炎来说，性活动是引起发病的重要原因。比较确定的是淋菌性前列腺炎，其绝大多数是由性活动使琳菌经尿道上行而造成的前列腺感染。
有学者对慢性前列腺炎患者及其性伴侣进行研究，发现经过培养的前列腺液和阴道分泌液经常含有一些相同的病原菌。由此可以发现某些慢性前列腺炎患者很可能是在性交过程中，女性阴道内的病原菌进入男性的尿道，并逆行进入前列腺，引起细菌性前列腺炎
此外，国外有研究表明在男性同性恋者中没有保护措施的肛交可以引起尿道炎、尿路感染和急性附睾炎，病原菌主要为大肠杆菌。
毫无疑问，这种性活动也不可避免地会引起细菌性前列腺炎
前列腺炎与尿道致病菌菌群以及逆行性尿路感染有着密切的关系，因此包括留置导尿管在内的尿液引流系统都可以引起前列腺的细菌感染尿液已有感染而未经治疗的患者在行经尿道前列腺切除术后很快就会发生细菌性前列腺炎
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