中医常根据女性尖锐湿疣患者的体质、疣体特点、全身症状等将其分为湿热下注证、外染毒邪证和气血瘀滞证3型。由于中药取材方便，标本兼治，目前仍有很多尖锐湿疣患者接受中医治疗。
1、湿热下注证
治疗以宜清利湿热，解毒消疣为主。常用方药由苍术、黄柏、生苡仁、土茯苓、丹皮、通草、泽泻、马齿苋等药物组成，方中苍术、黄柏清下焦湿热；生苡仁健脾除湿，具有抗病毒的功能；配土茯苓、丹皮、通草、泽泻、马齿苋解毒除湿，活血化瘀。临床应用时还可随证加减，对于湿热严重的患者，可加入龙胆草，便秘严重者可加入芦荟等等。
2、外染毒邪证
治疗以清热解毒为主。常用方药为去疣三号方，该方由马齿苋、败酱草、紫草、大青叶、木贼草等药物组成，方中马齿苋为君药，清热解毒；辅以败酱草、紫草、大青叶、木贼草加强清热解毒、活血散结之效。临床应用时还可随证加减，对于皮损灰暗，病程较长的患者，可加用蜂房、丹参、红花等活血化瘀之品。
3、血瘀滞证
治疗以理气活血、化瘀散结为主。常用方药为桃红四物汤，该方由桃仁、红花、川芎、当归、白芍、丹参、蜂房、柴胡、夏枯草等药物组成，方中桃仁、红花、川芎、当归、丹参、蜂房具有活血化瘀的功效；柴胡疏肝理气，引药直达病所；夏枯草清热解毒，软坚散结。临床应用时也可随证加减，对于气虚严重者可加用生黄芪以补气解毒，提高机体免疫力，对于疣体坚硬者，可加用生龙牡以软坚散结。
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