前列腺炎是男性生殖系统的常见病，由于急性前列腺炎有较明确的临床特点，故目前对它的诊断相对容易。
相反的，慢性细菌性前列腺、非细菌性前列腺炎和前列腺痛在临床上难以区分。
症状体征无法鉴别
由于慢性前列腺炎的临床特点非常不确定而且变异很大，慢性细菌性前列腺、非细菌性前列腺炎和前列腺痛许多症状和体征常无法鉴别，导致在临床上较难区分。
病理组织学表现不特异
前列腺的病理组织学检查只能诊断特殊类型的前列腺炎，如肉芽肿性前列腺炎。依靠慢性细菌性前列腺炎的组织学变化并不能明确引起炎症的病原体的特异性。
很多研究表明各类型的慢性前列腺炎综合征的病理组织学变化无差异，没有鉴别的意义。
此外，无论病原体检查是阳性还是阴性，所有标本均存在不同程度的局灶性慢性前列腺炎病理组织学变化，而且临床检查的病原体并不引起特异性病理组织学变化，这也进一步证实了病理组织学检查不能鉴别慢性前列腺炎综合征的类型。
辅助检查不能确诊
同样放射影像学检查、尿道膀胱镜等检查有助于鉴别诊断和明确并发因素，但均不能依靠它们确诊前列腺炎。因此，临床拟诊前列腺炎并不困难，但要明确病因和病原体绝非易事。
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