临床一般将前列腺特异性抗原作为前列腺癌的肿瘤标志物应用，它同时也是前列腺增生诊断过程中的常规检查项目，用以排除前列腺癌的可能，但其实前列腺特异性抗原缺少疾病特异性，除最被人们所了解的前列腺癌、前列腺增生能使其大幅升高外，许多疾病均可导致其血清浓度改变。
急、慢性前列腺炎均可导致血清前列腺特异性抗原浓度显著升高，其机制尚未清楚，推测可能与炎症过程导致前列腺上皮细胞产生前列腺特异性抗原增多、细胞凋亡使前列腺特异性抗原释放增多、保留前列腺特异性抗原于腺管系统的正常生理屏障被破坏及炎症导致血管通透性改变有关。
尿潴留
前列腺增生本身可导致轻、中度的前列腺特异性抗原升高，一般认为这是前列腺体积增大的结果，前列腺切除术后前列腺特异性抗原水平与切除的前列腺标本的肿瘤有直接关系。
但也有一些研究文献表明，前列腺增生所致的急性尿潴留也可导致前列腺特异性抗原水平的突然升高。有报道称急性尿潴留时血清前列腺特异性抗原水平较尿潴留缓解后高6倍。
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