继发性输卵管堵塞的病因主要由2类，即病理性病因和机械性病因。
1、病理性病因
导致继发性输卵管堵塞的病理性病因主要与输卵管病变有关，较为常见的是输卵管炎性病变，如输卵管炎，主要是由于病原体感染所致，常见病原体有葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌、淋球菌、变形杆菌、肺炎球菌、衣原体等。
值得注意的是，这类病原体引发的炎症感染往往是一过性的，十分短暂，但由感染性炎症引发的输卵管堵塞性不孕是永久的，不可自愈，给患者的身体健康会造成严重损害。
2、机械性病因
继发性输卵管堵塞的机械性病因主要是由于一些脱落的栓子以及器官功能性收缩导致的，在输卵管堵塞的病例中并不多见，容易被忽视。
常见的脱落栓子有月经期内膜碎片、血凝块等，也可能是由于药物流产或人工流产时子宫收缩和负压吸引突然解除导致的胚胎组织及其附属物进入输卵管造成的。另外，在女性不孕的病因检查中，由于医生技术操作不熟练或者患者自身对疼痛过于敏感等原因，也可能引发输卵管间质部发生痉挛，进而导致假性输卵管堵塞，这也是机械性病因的一种类型。
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