阴茎勃起障碍分器质性和功能性两类，阴茎组织由于某种原因受到实际损伤而发生的勃起障碍就可以认为是器质性的。比如阴茎血管先天性异常或阻塞，神经系统疾病，均可导致阴茎勃起障碍。
血管先天性异常或阻塞
如动脉硬化，动脉炎，阴茎异常勃起，局部血管血栓形成，栓塞，血管瘤;单侧或双侧阴茎动脉主支或分支发育不全及分布异常，血管丛异常，动静脉交通支异常，海绵体血流排放系统的异常均可导致器质性勃起障碍(可占60%~70%)。
神经系统患病因素
、脊髓和中枢部位肿瘤、脊髓损伤合并截瘫(睾丸血管去神经作用)、多发性硬化症、脊髓痨、脊髓裂、亚急性联合性退化、侧索硬化致肌肉萎缩、交感神经节切除术、腹膜后淋巴结清扫术、周围神经炎等都可造成支配阴茎勃起的神经发生病变，导致器质性勃起障碍。
特别提示：身体其他器质性的疾病所导致患者性生活耐力缺乏，阴茎勃起时间较短，或勃起不坚，甚或不能勃起，也可认为发生有器质性勃起障碍。比如心肌梗死后，肺气肿或肺功能不全，贫血，全身疾患(感染、营养)，代谢障碍(肾、肝衰竭)等都可导致患者性生活耐力大减，勃起功能障碍
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