骨髓移植是治疗再生障碍性贫血的有效方法之一，再生障碍性贫血患者植入健康人的骨髓，利用骨髓中能够产生血液和免疫细胞的干细胞而重建自身造血系统。
骨髓移植是所有移植手术中最严格的一种，移植供体和受体二者之间的配型要求极高，需要HLA(人类白细胞抗原)完全相合才能进行移植。因此寻找配型符合要求的骨髓移植供者相当困难，同胞之间仅有四分之一的机会配型成功，而非亲属之间的配型成功率仅为十万分之一。骨髓移植患者常因排斥反应而导致移植失败。
相对于骨髓移植，脐带血干细胞移植时HLA不需要完全相合，这使同胞之间、近亲属之间，甚至非亲属之间的配型成功率也大为增加，同胞之间的配型成功率可以高达75%。脐带血移植过程简便，脐带血的采集对于产妇和新生儿都无任何影响。脐带血移植后较少发生排斥反应，程度也较轻微。
相对骨髓移植，脐带血干细胞移植所引发的后遗症更少，而且干细胞的排斥机率也较低。因此脐带血干细胞可以取代骨髓用于治疗各种血液、免疫及代谢方面的多种疾病。
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