精囊炎容易使精液成份发生改变，单纯精囊炎较少见，精囊的慢性炎症可引起不育。精囊炎导致不育的原因如下：
精液混有毒素
精液中含有一些营养成分，来供养精于与助精于活动，也含有微量的乳酸等酸性物质。一旦精囊与前列腺发炎，精液中便会混合着细菌，乳酸物质也会增加细菌的毒素，其代谢产物也在精液中排泄，细菌又会吞掉精液中的营养，以及抢夺氧气，导致生育力下降。
精液不液化
精液中90%为精囊分泌物，其中果糖可以被精子利用作为动力来源；精囊炎时这些分泌物减少，可以影响精子的活力。在患有前列腺精囊腺炎时精液中就有细菌，又有许多白细胞，甚至混杂着脓液。粘稠度会忽然增加，精液不容易液化，精子活力降低，导致不育。
导致死精
正常精液酸碱度为7.2-8.9，精子在这种环境中活动很自由。发生精囊炎时，酸性物质会增加，导致精液呈现酸性环境，引起死精，导致男性不育。
精子减少
发生精囊炎时，精液的分泌量一般都会减少，这对精子的生存很不利，精囊炎伴有无菌性前列腺炎时，精液量有时候会增加，这样导致单位容积内精于数减少，使精子稀释也会影响生育。
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