目前对前列腺炎患者及具有前列腺炎样症状者病情的自然转归及治疗预后还不完全清楚，虽临床有一些观察结果可供参考，但均不是可靠结论，尚缺乏良好的循证医学证据。
急性前列腺炎经积极治疗者预后一般良好，但部分患者的临床症状持续存在，疾病由急性转为慢性的自然进程还不清楚，因此临床至少应该随访3个月，以观察预后，指导治疗。
慢性前列腺炎的自然病程和预后转归十分不清晰，尤其是慢性前列腺炎久治不愈的危险因素也仍有待讨论。
药物治疗慢性前列腺炎的疗效也难以评价，临床症状完全缓解率初步统计在30﹪~40﹪，余下的患者则有不同程度的前列腺炎症状。长期治疗者治愈率可达到50﹪，症状改善者可达25﹪。但仍有20﹪以上的患者治疗超过1年仍然没有任何效果，患者多数选择放弃治疗，无奈只能忍受疾病的痛苦。
手术的治愈率很大程度上取决于术者的操作技术，即使技术精湛的泌尿外科医师采用经尿道前列腺电切方法切除前列腺，也只有80﹪左右的患者能够得到治愈或改善。1992年一项国外研究发现，即使将患者的全部盆腔脏器都切除，其盆腔疼痛症状仍然可能存在，因此这些对常规药物及手术治疗无效的前列腺炎原因仍有待深入研究。
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