白塞氏病是一种血管炎症性疾病，其病因和发病机制至今仍不十分清楚，相关研究表明其病因可能与以下几点有关。
一、免疫
免疫机制发病学说1963年一些学者提出，以后渐被人们所接受。早期患者血清中存在抗口腔粘膜细胞抗体。以后有学者发现患者脑脊液中淋巴细胞增多，补体C3、IgG升高。还有学者发现患者血清中T4/T8之比减少和NK细胞的增多，同时NK的活力下降，这可能与IL-2和IFN-r的缺乏有关。
二、遗传
白塞氏病与人类主要组织相容性复合物即HLA系统，1973年日本学者首先报道白塞氏病与HLA-B5相关，以后进一步的研究认为白塞氏病与HLA-B的一个亚型HLA-B51强相关。此外HLA-CW14的出现频率也较高，且该基因与HLA-B有连锁不平衡，发现一个位于B和C点之间的HLA-1类相关新基因。HLA-B5亚型HLA-B51是白塞氏病的易感基因，而HLA-1类相关基因可能是决中定白塞氏病发病的基因。
三、感染
据报道我国1/3白塞氏病患者过去有结核病史或患活动性结核，结核菌素实验强阳性，经抗结核治疗病情缓解。
有学者发现相当多的患者于发病前总有一段发热病史，且在这些患者血清中找到链球菌抗原致敏的淋巴细胞，另外一些研究者则在发热患者的血和尿中查到病毒。
四、环境因素
白塞氏病分布有明显的地区性，以地中海、中东及东亚国家居多。环境污染、微量元素的变化等，特别是血中铜离子含量与疾病发作呈正相关。
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