脑起搏器治疗帕金森的效果对每位患者并非一样的，治疗后有的患者症状改善可达100%，有的患者只能改善30%～40%，有的患者甚至毫无改善。
脑起搏器治疗效果主要受患者因素的影响，一般而言，处于病程中晚期的患者，进行脑起搏器治疗后效果较好，此时药物治疗的效果越来越差，还会出现波动症状、开关症状及舞蹈样症状等，单靠药物治疗很难奏效，需要脑起搏器治疗。但是已经卧床不起、肌肉关节已经畸形的患者，就没有安装脑起搏器的必要了。另外，从药物治疗效果也能预测脑起搏器治疗的效果，通常对左旋多巴制剂敏感的患者，治疗效果较好，反之则治疗效果较差。
药物治疗和脑起搏器治疗两者是协同的关系，而非对立，因为在中晚期，即使加大药物剂量，疗效持续时间也很短，效果有限，起搏器治疗主要是为了改善患者在无药性作用期间的症状，以便提高生活质量。
脑起搏器治疗是一种可逆性的神经刺激法，需要将刺激电极及脉冲发生器植入体内，虽然是微创手术，安全性很高，但也有一定手术风险。
颅内出血、感染、皮肤切口延迟愈合或不愈合等是常见的手术并发症，另外患者术后还可能会出现麻木、头晕、乏力、发音含糊、声音低下及肌肉抽搐等副作用，增加患者的痛苦。
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