尿液检查对急性细菌性前列腺炎的临床诊断具有重要的参考价值。由于急性细菌性前列腺炎患者的前列腺感染及损伤较为严重，并且可有大量的病原菌随着过度分泌的前列腺液排出至尿道，且通常伴随急性膀胱炎一起发生。
因此，对于急性细菌性前列腺炎患者通常不宜进行前列腺按摩，根据膀胱尿培养的结果就可以初步确定急性前列腺炎的致病菌种。
虽然在诊断前列腺炎时多数学者推荐尿液细胞学检查，但到目前为止，还没有确切的证据表明单纯的尿液检查在慢性前列腺炎筛选中的价值，而传统的四杯试验定量检测尿液中的细胞成分对于判定炎症细胞的来源，从而诊断感染的部位非常重要。
慢性前列腺炎患者的尿液标本离心沉淀物镜检可以有少量的红细胞、白细胞或脓细胞，但也可能没有异常发现，这是由于尿液检查结果常常受到患者排尿间隔时间、是否接受过或正在进行抗菌药物治疗，以及采集尿液标本的方法等因素的影响而导致误诊或漏诊。
但是联合前列腺液和按摩后尿液分析就可以获得比较准确的结果，可以作为慢性前列腺炎的诊断手段之一，尤其是在前列腺液难以获得的时候就更有意义。
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