尖锐湿疣系病毒引起，目前还没有特效的抗病毒药物，因此，易于复发。尖锐湿疣的治疗大多以去除疣状物，改善症状为主。
1.冷冻治疗：用冷冻方法可使尖锐湿疣内结冰，形成组织局部的高度水水肿，从而破坏疣体。冷冻治疗的最大好处是局部不留痕迹，治愈率约70%左右。适用于疣体不太大或不太广泛的病人。该方法病人比较痛苦，且复发率较高。可进行1-2次治疗，间隔时间为1周。
2.电灼：用高频电力或电针烧灼。它的特点是操作简单，见效快。能直接切除和干燥疣体，治疗也较彻底。可用于任何尖锐湿疣的治疗，但是对施术者的技术要求较高，烧灼太过或不足都是有害的。由于电烧灼后皮肤表面愈合较缓慢，所以治疗后要注预防感染。
3.手术切除：尖锐湿疣一般不主张手术切除，因为手术治疗后，尖锐湿疣很容易复发，使治疗失败。但对带蒂的较大的疣体，如有的患者尖锐湿疣生长过于迅速，或大如菜花，其他方法治疗十分困难，可考虑手术治疗。为防止复发，术后配合其他治疗。
4.局部外用药物：10%-25%足叶草脂酊或0.5呒足叶草毒素外用，每日两次，后者浓度低，局部刺激性小，吸收后中毒的可能性极少。该药是国外用于本病治疗的首选药，一般用一次可愈。缺点是对组织破坏性大，使用不当可引起局部溃疡;毒性也大。中毒后表现为恶心、肠梗阻、白细胞及血小板减少，尿闭或少尿，故使用时必须谨慎，发现上述反应，应立即停药。本药有致畸作用，孕妇禁用。
还可用3%肽丁胺霜，外用，每日两次，本药刺激性小，疗效较好，或用0.25%疱疹净软膏，每日两次，外涂。
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