癫痫灶多位于原发病变的周围，其病理学的改变应以原发病灶为基础，其病灶的病理变化主要有如下表现。①肉眼所见：局部与硬脑膜粘连或瘢痕形成，局部蛛网膜增厚与软膜粘连，有的局部脑皮质萎缩，苍白质硬，软脑膜毛细血管增多或稀少，有的形成局部蛛网膜囊肿等。②光镜所见：大脑皮质病灶区神经细胞深染、皱缩、变性，有的细胞肿胀，神经元数量减少，形态分布异常，胶质细胞增生，小血管结构缺陷或畸形等。
③电镜所见：病灶组织可见细胞肿胀，部分细胞质内初级溶酶体增多，并有次级溶酶体出现，细胞核膜皱缩，异染色质呈团块状，并有核边染现象，严重者神经细胞可见残骸，血管内皮细胞肿胀，周围间隙增生，有的血管腔闭塞，神经元内线粒体增多肿胀并有异常，突触小泡消失，部分髓鞘出现膜性空泡，粗面内质网扩大呈空泡状，核蛋白体脱失，高尔基器呈不规则的片断结构;神经元轴索变性，髓鞘板层结构分离或崩溃呈空泡性磷脂碎屑;突触终板内突触小泡呈球形。
神经内轴-轴突触，轴浆基质内见囊性扩张的光面内质网。部分患者见胶原纤维增生，部分见血管基膜增厚，内皮细胞内有较多的吞噬小泡。
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