新生儿癫痫指发生在出生后28天以内的癫痫。发病原因比较多，如基因遗传、先天发育异常、分娩产伤、颅内感染、颅脑外伤、热性惊厥等，都可以引发癫痫。
由于新生儿大脑皮质发育尚不完善，任何不良刺激均可导致大脑皮层异常放电，脑电图检查阳性率比较高，引发新生儿癫痫的几率也比较高。
新生儿癫痫的发病因素大致可以分为以下三种：
有胎儿脑发育异常、胎儿脑血管闭塞、产前胎儿感染、母亲在孕期服用激素、麻醉品、酒精等致胎儿先天性代谢缺陷，以及母亲孕期患病、遗传性惊厥。
有各类产伤、胎儿颅内或颅外感染、孕妇难产时不慎把麻醉药注射在小儿头皮上。
有代谢紊乱、产后感染、颅内出血、缺氧缺血性脑病，其中以围生期窒息缺氧为最常见病因，其次是代谢异常和产伤。
无论是产前因素还是产后的外界因素都是可以导致新生儿患上癫痫病的，但是遗传因素是导致新生儿癫痫发病，尤其是特发性癫痫的重要原因。分子遗传学研究发现，新生儿癫痫发病机理是一部分遗传性癫痫的分子机制为离子通道或相关分子的结构或功能改变。
离子通道是体内可兴奋性组织兴奋性调节的基础，其编码基因突变可影响离子通道功能，从而导致某些遗传性疾病的发生。目前认为很多人类特发性癫痫是离子通道病，即有缺陷的基因编码有缺陷的离子通道蛋白而发病，其中钠离子、钾离子、钙离子通道与癫痫相关性的研究较为明确。
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