小儿消化不良是儿科胃肠道常见病多发病，其临床表现主要为上腹部不是。恶心、呕吐或腹痛、腹胀等，引起患儿食欲减退，同时可能伴随出现神经及精神系统疾病和症状。引起小儿消化不良的疾病有很多，因此在诊断的时候还需仔细鉴别，以免出现误诊、漏诊的情况。
小儿消化不良的鉴别诊断疾病主要为3种，分别为胃-食道反流性疾病，溃疡性消化不良和胃轻瘫
其中胃-食道反流性疾病与小儿消化不良诊断有一定难度，应观察患儿是否出现典型或者不典型的反流的临床症状，通过内镜检查是否出现食管炎临床病变，并检测患者pH的波动范围。虽然两种疾病诊断比较困难，但两种疾病临床的治疗疾病相同。
与溃疡性消化不良比较，主要包括十二指肠溃疡、幽门管溃疡、十二指肠炎或糜烂性胃窦炎等，在进行小儿消化不良诊断时应排除以上器质性临床病变。与胃轻瘫进行分辨诊断时应观察患者使用存在可能引起胃轻瘫的病因，主要的病因为糖尿病、风湿性疾病和尿毒症。
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