药物流产的副作用最小的也容易引起月经失调，表现为月经周期缩短或延长，月经量增多。而对于未生育的妇女来说，如果反复使用，不仅容易引起感染或大出血，还有可能导致不孕，造成终身遗憾。
其实，不管手术刮宫还是药物流产，除了对肉体上的损伤外，其引起的激素变化对人体的伤害也是难以察觉的。肉体上的损伤很快就可以修复，但内分泌变化对人体的打击却不是一天两天就能恢复过来的。瓜熟蒂落的分娩，是按一定规律进行的，机体对此有充足的适应与准备时间，而人为的中断怀孕，机体由于内分泌功能突然急骤下降，没有一个缓慢的适应过程，这对人体隐性的打击才是最大的。
而且，由于药物流产会留下一定的并发症，因此，目前医学上规定，药物流产只能在具有一定设备的医疗保健机构中使用，以便在出血多或出血时间较长的情况下进行手术刮宫，以及抗感染，输液和输血治疗。所以，千万不要在家用随意滥用，应该由有经验的妇产科医生根据具体情况来决定。
同时药物流产后的调养也是很重要的，虽然没有器械的损伤，但药物流产所致的阴道流血，比平时月经量多，持续时间长，尤其不全流产者可导致失血性贫血，还会引起阴道乃至盆腔感染。
因此，药物流产后要注意调养。
药物流产后要休息１——２周，以免抵抗力降低诱发其他疾病；、营养方面注意补铁（牛肉、瘦肉、肝、肾、蛋黄、血类、青菜，水果，含铁多），蛋白质摄入量要足够，还要多吃富含维生素的食品；、注意个人卫生，洗澡以淋浴为宜，居室向阳，通风，保持环境卫生；、药物流产后最好２——３周后再进行房事，并注意采取避孕措施，以免再次怀孕
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