慢性肠炎泛指肠道的慢性炎症性疾病，其病因可为细菌、霉菌、病毒、原虫等微生物感染，亦可为过敏、变态反应等原因所致。临床表现为长期慢性、或反复发作的腹痛、腹泻及消化不良等症，重者可有粘液便或水样便。那么，慢性肠炎的病因是什么呢?
1、自身免疫：随着社会发展，医学的进步，免疫学的快速成长，有很多不明病因的都以探明。
目前，免疫疾的发病率高，治疗困难，已引起重视。因此，慢性结肠炎在常规治疗是下难以得到治疗的。
2、感染因素：通过生活中感染因素的影响，往往也可引起慢性肠炎的发生。虽然在粪便中未能检致病菌、病毒或真菌。每当发病时，使用抗生素则有不同程度控病情和治疗效果，这说明抗生素具有抑制大肠杆菌及其它致病菌，可减低临床症状，一般认为都与感染有关。
3、过敏因素：过敏因素的影响也是导致慢性肠炎的原因之一。过敏性病变，受个体差异影响。主要是肠道性过敏，也时有累及皮肤。过敏性反应，是受致敏物质刺激，自身免疫引起反应，释放出自卫物质而激发大量免疫细胞凝聚、均结集在消化道粘膜表面，从而引起粘膜表面水肿充血及渗液等炎症发生。
过敏性反应是随着人类生活、饮食习惯的改变，个体的差异，是消化过敏的主要因素。
日常生活中，引起慢性肠炎的因素是非常多的，人们应引起注意，全面的做好预防工作。若是不幸患上了慢性结肠炎，应找准自身的病因，根据病因选择合适的方法去接受治疗。
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