直肠炎的病因，医学界认为直肠炎病因主要与慢性炎症刺激、血吸虫、痔疮、肛瘘、肛裂、化脓性汗腺炎、良性肿瘤恶变、性病、饮食等因素有关，但确诊直肠炎的病因还有待于详细的检查来确定。
专家讲，直肠炎轻者仅粘膜发炎，重者炎症累及粘膜下层、肌层，甚至直肠周围组织;有时只是一部分直肠粘膜受累，有时直肠粘膜全部发炎，也可累及结肠部分粘膜都有炎症。
一、异物损伤：为常见的病因是直肠内异物损伤。未消化的骨片、木片或其它带有锐利角的各种异物可直接损伤直肠粘膜而发生直肠炎。此外，发生严重便秘时的坚硬粪便块，可引起直肠炎。
二、中毒和感染症：发生灭鼠药或重金属(汞、砷等)中毒或者发生以胃肠炎为主要特征的传染病时，常常继发直肠炎。不过此时，与直肠相比，其它胃肠管的病理变化更加严重，而且，大多数病例由此病因而表现临床症状。
三、良性肿瘤恶变：这种疾病也是直肠炎发病原因之一，一般直肠家族性息肉病、直肠腺瘤、乳头状瘤等，在一定条件下，也可导致恶性病变。
四、饮食因素：高脂肪、高蛋白、低纤维素的饮食与直肠炎发病有关。这是因为高脂肪食物可使胆汁分泌增多，促进肠道细菌生长，而胆醇、胆盐在厌氧菌作用下，形成不饱和胆固醇，如脱氧胆酸和石胆酸增加，这二种致炎物数量增加，促进直肠炎发病。
同时，食物纤维摄入过少，使肠蠕动变慢，粪便及其他废物在肠道滞留过久，刺激肠粘膜，致使直肠炎发生。在现代快节奏的生活中，很多人在忙碌工作和学习的同时，忽略了对身体健康方面的问题。不良的生活习惯使得越来越多的人患上了肛肠疾病。
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