如果孕妇被诊断患有胆囊癌，医生、她本人及其家庭都将面临一个艰难的选择：是母亲的健康重要，还是胎儿的健康重要？众所周知，在怀孕前12周内使用化疗药物的话将会导致出生缺陷发生危险上升，因为此时胎儿器官正在形成。如果推迟化疗，又会导致癌症扩散。
在过去的10年里，虽然医生们常选择在怀孕三月后才使用化疗药物，大家仍然担心胎儿的大脑和心脏是否会受到损伤。
除了妊娠头三个月（此时期为胚胎器官形成期，容易受到影响），化疗药物可能对胎儿造成损害外，其他时间应用化疗药物对胎儿的影响有待进一步证据。
这是因为一方面，胎盘本身存在胎盘屏障，可将化疗药物屏蔽于外，不让其进入胎盘危害胎儿；另一方面，胎盘还有一种自动清除有害物质的作用，能将不慎闯入的药物清除出去。
临床上见到的病人，几乎都会选择延迟化疗，也就是分娩后再进行化疗。她们主要是担心化疗药物可能会对胎儿造成不良影响。而这种选择对于尽早治疗胆囊癌是不利的。
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