再生障碍性贫血也可以出现在怀孕的时候，可能是偶然的，也可能与某些可能因素有关。再生障碍性贫血患者在怀孕期间病情可能发生恶化，经免疫抑制治疗缓解后，再生障碍性贫血患者在怀孕期间还是有很高的复发风险。
异基因骨髓移植成功的再生障碍性贫血患者，妊娠一般不会导致复发风险增加。因此，妊娠再障患者需要经历一个困难时期，需要密切观察及小心治疗。
由于预防措施的进步，如今大部分再生障碍性贫血患者可以安全度过妊娠期，其中很大程度上得益于支持治疗，特别是成分输血治疗。仅通过输血维持血红蛋白在80g/L以上、血小板不低于20×109/L，再生障碍性贫血孕妇的死亡率极低。
由于再生障碍性贫血疾病的特殊性及孕期妇女的生理变化，患者和其胎儿在妊娠期会持续存在一定风险，患者及家属应向专业产科医生详细了解其潜在风险，在综合评估相关风险后由患者最终决定是继续妊娠，还是终止妊娠。
即使是症状不严重、病情稳定了以后，再生障碍性贫血患者在怀孕期也可能出现其他一些突发意外事件，或者是病情迅速进展，从而导致严重的后果，因此再生障碍性贫血还是应慎重选择要不要继续妊娠。
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