婴儿口腔溃疡有四个原因：
一、手足口病引起口腔溃疡
手足口病引发口腔溃疡的症状好发于5岁以下幼儿且具有流行性。患病后口腔损害遍布于唇，颊、舌、腭等处，为很多小水疱，极易破裂，破后形成多个小溃疡，除口腔部位外，在手掌、足底、臀部皮肤上亦可出现分散的小水疱，所以称之为手足口病。
二、病毒感染引起口腔溃疡
婴儿的口腔溃疡和成人溃疡是两回事。
是口腔黏膜病毒的传染病，致病病毒是单纯疱疹病毒(以下简称疱疹病毒)HSV)，而且有复发的可能。HSV口腔粘膜引起的感染称为疱疹性口炎，多见于6岁以下儿童，尤其是6个月至2岁。病毒感染后，宝宝会因疼痛而烦躁、哭闹、拒绝进食、流口水。久而久之，肯定会影响宝宝的健康。
三、药物过敏引起口腔溃疡
特殊体质的婴儿可能会因药物或感染等不明原因而导致所谓的"多形性红斑病"，此时，婴儿会出现靶红斑、眼睛、嘴唇、口腔、生殖泌尿道炎症、溃疡。
四、外伤引起口腔溃疡
烫伤、刺伤、误食腐蚀性物质等，都会造成口腔粘膜损伤，进而引起口腔溃疡。
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