当下，虽然器官来自于捐献，但患者也要负担器官的获取的费用，主要是获取、运输、保存、检测以及手术医药费等，由于收费没有规范制度可循，一些花费并没有统一的标准，因此不同患者的获取费用并不尽相同,但普遍都在数十万元。
另外，在器官移植后，患者还是需要服用解决器官排异的药物，这也是一笔不小的负担。
根据专家的说法，每年在30万需要移植器官的病人中，真正在医院等待的、能支付器官移植费用的只有3万人，这意味着，百分之九十的病人因经济条件被拒绝在医院大门之外。当然，由于捐献器官数量同需要器官移植治疗的患者数量之间巨大的差距。中国每年器官移植手术仅为1万余例。
虽然器官捐献与移植事业迅猛发展，但捐献器官数量同需要器官移植治疗的患者数量相比还存在巨大差距。
移植费用也是患者望而却步的问题之一。从全球器官移植服务的价格来看，中国的器官移植收费并不算高。
比如一例肝脏移植，在美国收费标准约为60万美元;在中国经济发达地区，约为60万元人民币，在西南经济欠发达地区，收费在30万40万元人民币。但由于没有统一的价格标准，中国器官移植也未纳入“医保”，所有费用靠患者自付。不少患者因经济原因，“徘徊”在器官分配等待名单外。
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