经过国内资深专家研究发现非淋菌性尿道炎虽然都是经过致病菌侵入尿道而引起的感染，但是表现在患者身上的情况都不一样，有些患者久治难遇，有些患者经过治疗能够得到很快改善。
这呈现出该病种的复杂多样。
(一)治疗
1、目前对四环素、强力霉素、红霉素已有不少菌株产生耐药。新一代合成抗菌药喹诺酮类，不但对衣原体、支原体有效，对淋球菌也高度敏感。(1)氟哌酸200mg,3/d共用14d。(2)氟嗪酸200mg,2/d共用14d.(3)环丙氟哌酸250mg,2/d，共用14d。
2、磺胺、利福平对衣原体有效，对支原体无效。
3、庆大霉素、新霉素、多粘菌素对衣原体无效。
4、链霉素、壮观霉素对衣原体无效，对支原体有效。5、四环素0.5g，4/d，共用7d，改0.25g,4/d,共用14d。
6、强力霉素0.1g,2/d，共用7d。
7、红霉素硬脂酸盐0.5g，4/d，共有7d。
8、红霉素琥珀酸乙酯0.8g，4/d，共用7d。
9、美满霉素0.2g即刻，0.1g，2/d，共用14d。
(二)判断治愈标准治疗结束一周应随访复查。治愈标准：
1、临床症状消失1周以上，尿道无分泌物，或分泌物中白红胞≤4个/100倍显微镜。
2、尿液澄清，沉渣镜检阴性。
3、尿道(宫颈)标本衣原体、支原体检查阴性(有条件时)。七、患非淋菌性尿道炎后应注意哪些问题?治疗期间禁饮酒、劳累、熬夜性生活。夫妻双方有一方感染时，双方应同时检查治疗。不与别人共用洗阴部的毛巾、盆具，不混用内衣裤。家中有婴幼儿者，要严格物品及手的消毒，以防通过密切接触传播。性生活时使用避孕套可减少非淋菌性尿道炎的传播。
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