蛹虫草入药主要使用其子实体和菌核部分。蛹虫草是麦角菌科真菌蛹虫草的子座及幼虫尸体的复合体，其药用部位包含虫体与顶端棒状子实体。
蛹虫草的子实体是其核心药用部位，呈橙黄色棒状，富含虫草素、腺苷、多糖等活性成分，具有调节免疫、抗疲劳等作用。菌核部分由被真菌侵染的昆虫幼虫尸体形成，含有蛋白质、氨基酸及微量元素，常与子实体共同入药。传统中医认为两者协同可补肺益肾，现代研究则证实其提取物对心脑血管和呼吸系统有一定保护作用。蛹虫草需经清洗、干燥等炮制后使用，常见于煎剂、粉剂或胶囊制剂。
使用蛹虫草时需注意过敏反应，避免与辛辣刺激食物同服。建议在中医师指导下根据体质辨证使用，不宜长期过量服用。日常储存应置于阴凉干燥处，防止霉变。孕妇、儿童及湿热体质者慎用，服用期间出现恶心、皮疹等症状应及时停用。
