HPV病毒在人体内的维持时间差异较大，低危型感染可能持续数月到两年，高危型感染可能持续数年甚至更久。具体时间与病毒类型、个体免疫力等因素有关。
低危型HPV感染如引起尖锐湿疣的6型、11型，约50%感染者的免疫系统可在6-12个月内清除病毒，90%在两年内清除。病毒清除后疣体可能消退，但少数人可能因免疫力低下出现复发。高危型HPV如16型、18型与宫颈癌相关，持续感染时间较长，约10%感染者可能持续感染超过两年，这部分人群需警惕癌变风险。病毒维持时间与宫颈上皮细胞病变程度相关，轻度病变者可能自然消退，中重度病变需医疗干预。
免疫缺陷患者如HIV感染者、器官移植后服用免疫抑制剂者，HPV清除能力显著下降，病毒维持时间可能延长至十年以上，且易进展为顽固性疣体或上皮内瘤变。吸烟、长期口服避孕药、多性伴侣等因素也会延长病毒维持时间。男性HPV感染清除速度快于女性，但阴茎、肛周等部位可能成为病毒储存库，导致反复传播。
建议定期进行HPV筛查和宫颈细胞学检查，保持规律作息、均衡营养以增强免疫力，避免吸烟和酗酒。出现生殖器疣或异常阴道出血时应及时就医，高危型感染者需遵医嘱进行阴道镜或活检检查。
