男性HPV感染可通过醋酸白试验、HPV核酸检测、细胞学检查、组织病理活检、抗体检测等方法筛查。HPV主要通过性接触传播，高危型持续感染可能诱发阴茎癌、肛门癌等恶性肿瘤，需结合临床表现选择检查方式。
将5%醋酸溶液涂抹于可疑皮损处，3-5分钟后观察是否变白。该方法适用于可见生殖器疣体初筛，但可能出现假阳性，需结合其他检查确诊。典型尖锐湿疣表现为菜花状、乳头状赘生物，多发生在包皮、尿道口等部位。
采用PCR技术检测分泌物或脱落细胞中的HPV-DNA，可明确具体亚型。高危型如HPV16/18与肿瘤相关，低危型如HPV6/11多引起良性病变。采样时需用专用刷头旋转采集尿道口、肛周等黏膜脱落细胞，检测前24小时避免局部用药。
通过采集病变部位细胞进行巴氏染色镜检，观察细胞空泡化等特征性改变。适用于无明显疣体但存在可疑溃疡、白斑的情况。该方法与宫颈TCT原理相似，但男性尿道细胞获取量较少可能影响准确度。
对可疑增生组织进行取样活检，病理可见棘层增厚、挖空细胞等典型表现。适用于醋酸白试验阳性但临床表现不典型，或怀疑癌变的情况。活检能鉴别尖锐湿疣与扁平苔藓、鲍温样丘疹病等类似疾病。
通过抽血检测血清HPV抗体，间接反映感染情况。但因抗体产生较滞后且无法区分既往感染与现症感染，临床多作为辅助手段。部分研究显示HPV抗体水平与口咽癌风险存在相关性。
建议有多个性伴侣或同性性行为者定期筛查，接种九价HPV疫苗可预防90%以上相关疾病。日常避免共用剃须刀等个人用品，性行为中使用避孕套可降低传播风险。如发现阴茎、龟头等处出现不明赘生物、溃疡，应及时前往皮肤性病科或泌尿外科就诊。
