HPV疫苗不能完全预防全身感染HPV，但能有效预防疫苗覆盖型别引起的感染及相关疾病。
目前上市的HPV疫苗包括二价、四价和九价，主要针对高危型HPV16、18型及部分低危型。疫苗通过诱导机体产生中和抗体发挥作用，对宫颈、外阴、阴道等黏膜部位的保护效果最明确。疫苗对未暴露过的型别防护效果较好，但不能清除已存在的感染。接种后仍需定期筛查，因疫苗未覆盖所有高危型HPV。
免疫应答存在个体差异，抗体水平随时间可能下降。免疫功能低下者防护效果可能减弱。HPV主要通过性接触传播，疫苗接种后仍需采取安全性行为。疫苗对非覆盖型别的HPV无交叉保护作用，无法预防所有HPV感染。
即使接种疫苗，也应保持良好的生活习惯，避免多个性伴侣等高风险行为。30岁以上女性建议每3-5年进行宫颈癌筛查。发现异常症状及时就医，不可因接种疫苗而忽视常规体检。医务人员接种后仍需遵循标准防护措施，防止职业暴露感染。
