安全期怀孕的概率较低，但仍存在约百分之几的可能性。安全期避孕法通过推算女性排卵期避开易受孕时间，但排卵可能受多种因素干扰导致意外怀孕。
正常情况下月经周期为28天的女性，排卵多发生在下次月经前14天左右，卵子存活时间约24小时，精子在女性生殖道可存活3-5天。理论上避开排卵日前5天至后2天的危险期可降低怀孕概率。但月经周期不规律、环境变化、情绪波动、疾病或药物等因素均可导致排卵提前或延后，部分女性还可能发生额外排卵。安全期避孕法的实际失败率明显高于其他避孕方式，尤其对于月经周期不稳定的青少年或围绝经期女性。一项包含数千名女性的临床观察显示，使用安全期避孕法一年内的意外妊娠率显著高于避孕套或短效避孕药。
若月经周期长期规律且能准确监测基础体温、宫颈粘液等排卵征兆，安全期避孕效果会有所提升。但仍有案例显示，即使严格遵循安全期计算，仍可能因隐性排卵或精卵存活时间延长导致受孕。哺乳期、流产后的特殊生理阶段更易出现排卵时间异常，不宜依赖此法避孕。
有生育需求的夫妇可通过记录基础体温、使用排卵试纸等方法提高安全期避孕可靠性，但建议搭配避孕套等屏障法。若无怀孕计划，优先考虑复方短效避孕药、宫内节育器等高效避孕方式。若安全期同房后出现月经延迟、乳房胀痛等早孕症状，需及时进行早孕检测。
