HPV检查发现有囊肿通常是宫颈囊肿或阴道囊肿的表现。宫颈囊肿多是慢性宫颈炎引起的腺体堵塞，阴道囊肿可能与先天发育异常或外伤有关。HPV感染与囊肿无直接因果关系，但两者可能同时存在。
宫颈囊肿多为宫颈转化区内腺体开口被鳞状上皮覆盖，导致黏液潴留形成囊泡。这类囊肿通常体积较小，呈透明或淡黄色，多无压痛。慢性炎症刺激可能导致宫颈表面积增大，妇科检查时更易发现微小囊肿。阴道囊肿常见于阴道壁中段的加特纳管残留，囊壁薄且内含清亮液体，直径一般不超过2厘米。若囊肿位置较深或体积较大，可能伴随同房不适或少量异常分泌物。
HPV持续感染可能导致宫颈上皮内瘤变，但与囊肿属于不同病理过程。HPV检测取样时若触及囊肿可能引发出血，但不会影响检测准确性。囊肿合并HPV感染时，需分别处理两者，囊肿是否需要治疗取决于是否引起症状或影响生育功能。阴道后壁囊肿可能压迫直肠导致排便困难，前壁囊肿可能影响排尿，这类有临床症状的囊肿需考虑手术切除。
建议每1-2年进行宫颈癌筛查，包括HPV检测和TCT检查。日常生活中避免使用刺激性洗液冲洗阴道，选择纯棉透气内裤。发现异常阴道分泌物或接触性出血时尽早就医，不要自行按压或针刺囊肿。术后患者应禁止同房和盆浴1个月，遵医嘱使用抗感染药物预防创面感染。
