免疫力水平的高低影响HPV病毒的清除能力，但无法直接抵抗HPV感染。感染HPV后可能出现尖锐湿疣、寻常疣等症状，也可能无明显表现。HPV病毒感染的清除主要依赖人体免疫系统功能，临床尚无特效药物。
当HPV病毒感染人体后，免疫系统会识别并启动特异性免疫应答，通过激活T淋巴细胞和B淋巴细胞产生抗体来清除病毒。免疫系统功能较强的人群可能在6-12个月内自行清除病毒。免疫系统功能正常者大多能依靠自身免疫力控制HPV感染。保持规律的作息习惯有助于维持免疫功能稳定。
免疫系统功能低下会导致HPV病毒持续感染。艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂者等免疫力低下人群更易发生HPV持续感染。这部分人群可能出现病变持续进展。临床上可见部分患者因免疫力低下导致尖锐湿疣反复发作。孕妇因免疫耐受状态也可能出现HPV感染加重的情况。
接种HPV疫苗能有效预防HPV感染，但不能治疗已存在的感染。建议适龄人群在医生指导下接种疫苗。提高免疫力无法替代定期宫颈癌筛查，HPV感染者应按医嘱随访。出现生殖器疣体或其他症状时需及时就医，医生会根据情况给予冷冻治疗、激光治疗等处置方案。
