直肠HPV感染可能无明显症状，部分感染者可能出现肛门瘙痒、肛周疣状赘生物、排便异常或出血等症状。HPV感染主要与低危型和高危型病毒相关，低危型常引起尖锐湿疣，高危型可能与肛门癌前病变有关。
多数直肠HPV感染者无明显不适，尤其免疫力正常时病毒可能长期潜伏。定期肛周HPV筛查有助于早期发现，特别是性活跃人群或男男性行为者。无症状阶段无须治疗，但需监测病毒载量变化。
肛周皮肤或直肠黏膜受HPV刺激后可出现持续瘙痒，抓挠可能导致皮肤破损。瘙痒可能与低危型HPV6、11感染相关，伴发尖锐湿疣时症状更明显。保持局部清洁干燥有助于缓解，必要时可遵医嘱使用干扰素凝胶。
低危型HPV引起的肛门尖锐湿疣表现为菜花状、乳头状突起，质地柔软易出血。疣体可能单发或融合成片，大小从米粒至蚕豆不等。确诊后可采用冷冻治疗或外用咪喹莫特乳膏，较大疣体需手术切除。
直肠内HPV病灶增大可能引发排便不适、异物感或里急后重。高危型HPV16、18持续感染可能导致直肠黏膜上皮内瘤变，伴随排便习惯改变。肛门指诊和高分辨率肛门镜可辅助诊断，必要时需病理活检。
疣体摩擦破裂或癌前病变溃烂时可能出现便血，常为鲜红色且附着于粪便表面。长期出血需警惕肛门癌风险，建议联合检测HPV分型及TCT。止血可应用云南白药胶囊，但需明确出血原因后再针对性治疗。
建议避免高危性行为并接种HPV疫苗预防感染，出现肛周赘生物或反复出血应及时就诊肛肠科。保持规律作息和均衡饮食有助于增强免疫力，日常清洁应选用无刺激湿巾，避免使用碱性肥皂过度摩擦患处。性伴侣同治可降低交叉感染概率。
