HPV转阴后接种疫苗仍有一定保护作用，但效果可能弱于阴性时直接接种。HPV转阴通常指高危型病毒被清除或检测不到，此时接种疫苗可预防其他未感染的HPV亚型，但对已感染过的亚型预防效果有限。
若前期感染的是HPV16或18型等高危亚型且已转阴，疫苗可降低再次感染风险并预防其他高危亚型。由于HPV疫苗覆盖多种亚型，如九价疫苗能预防9种病毒亚型，即使曾感染其中几种，接种后仍能获得针对剩余亚型的保护。
若转阴后已通过免疫系统产生抗体，接种疫苗可能无法显著提升对该亚型的抗体水平。部分研究显示，自然感染产生的抗体滴度低于疫苗接种诱导的抗体水平，因此接种仍有助于强化整体免疫屏障。
建议HPV转阴后尽早接种疫苗，同时定期进行宫颈癌筛查。即便完成全程疫苗接种，仍需每3-5年做一次TCT和HPV联合检测。保持健康生活方式有助于提高疫苗保护效果，包括均衡饮食、规律作息、适度运动及避免吸烟等。
