巴戟天具有补肾壮阳、强筋健骨、祛风除湿的功效，主要用于改善肾虚阳痿、筋骨酸软、风湿痹痛等症状。
巴戟天性温味甘，归肾经，能温补肾阳，常用于肾阳虚引起的阳痿、遗精、早泄等男性功能障碍。现代研究表明其活性成分可调节性激素水平，如巴戟天多糖能提升血清睾酮含量。肾阳虚者多伴随畏寒肢冷、腰膝酸软，可遵医嘱搭配肉苁蓉、淫羊藿等药物加强疗效，如使用巴戟天颗粒或巴戟口服液。
巴戟天含有耐斯糖等成分，可促进骨形成蛋白表达，改善骨质疏松及筋骨无力。适用于中老年肝肾不足导致的腰膝酸痛、下肢萎软，常与杜仲、续断配伍，如巴戟天杜仲胶囊。动物实验显示其提取物能显著增加骨密度，但须避免与辛辣食物同服影响药效。
对于风寒湿邪侵袭关节引起的痹痛、屈伸不利，巴戟天可通过抗炎镇痛作用缓解症状。其甲醇提取物能抑制前列腺素E2合成，临床多与独活、桑寄生组成复方，如巴戟天风湿酒。风湿性关节炎急性发作期建议配合物理治疗增强效果。
巴戟天中的环烯醚萜类化合物可增强巨噬细胞活性，提高机体免疫力。适用于病后体虚、易感风寒者，常与黄芪配伍制成巴戟天益气合剂。研究提示其免疫调节作用呈双向性，过量可能抑制免疫，需严格控量。
巴戟天能降低血清尿素氮和乳酸含量，延长运动耐受时间，改善亚健康状态下的慢性疲劳。肾气虚型疲劳综合征患者可选用含巴戟天的中成药如巴戟天胶囊，配合八段锦等温和运动效果更佳。阴虚火旺者慎用以免加重口干咽燥症状。
使用巴戟天需辨证施治，肾阴虚火旺者忌用。日常可搭配黑豆、核桃等食材煲汤，避免与藜芦同服。煎煮时建议先煎30分钟以上以充分释放有效成分，服用期间忌食生冷油腻。若出现心悸、头晕等不良反应应立即停用并就诊。长期连续使用超过2个月需咨询中医师调整方案。
